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某mRNA长度对应一条完整多肽的翻译全程需要200秒。翻译起始后,核糖体每隔25秒在起始位点重新起始一次,同一mRNA上可同时容纳多个核糖体(多聚核糖体),且每个核糖体完成翻译需200秒,起始位点无空间限制。假设t=0时第一个核糖体起始,问:(1) 翻译进行到稳定状态时,该mRNA上同时结合的核糖体最多有多少个?(2) 从起始开始计时,600秒内该mRNA共能合成出多少条完整的多肽链?请给出计算过程。
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大肠杆菌核糖体为70S颗粒,其完整核糖体的总质量约为2700 kDa,由30S小亚基和50S大亚基组成。已知小亚基中含16S rRNA,质量约为500 kDa;大亚基中含23S rRNA和5S rRNA,质量分别约为1000 kDa和40 kDa;此外亚基中其余组分均为核糖体蛋白质。不考虑亚基结合时的质量损失,请计算一个完整70S核糖体中所含核糖体蛋白质的总质量,并据此说明核糖体的功能(如肽键催化)主要由哪类组分承担这一结论的含义。
某前体蛋白由一条120个氨基酸残基的多肽链组成,经翻译后加工,切除N端的一段18个氨基酸残基的前导序列,同时肽链中10个谷氨酰胺残基全部发生脱酰胺修饰,转变为谷氨酸残基。请计算:(1) 加工后该成熟蛋白含有的氨基酸残基总数;(2) 该脱酰胺修饰过程中净释放出的氨分子(NH₃)数目。
某实验室以一段双链DNA为模板进行PCR扩增,反应体系中初始含目的片段双链分子800个,共进行20个循环。已知该反应的扩增效率为80%(即每一循环结束后,双链DNA分子总数变为上一循环结束时的1.8倍),且引物设计正确、无非特异扩增。请计算20个循环结束后体系中目的片段双链分子的理论总数(保留三位有效数字),并根据PCR基本原理说明:引物只能与模板单链的哪一端互补结合、延伸方向是什么?
用Sanger双脱氧链终止法测定一段DNA。已知模板链为 3'-TACGGTAC-5'(8个碱基),测序反应中设四个平行管,分别额外加入少量ddATP、ddTTP、ddCTP、ddGTP。请回答:(1) 写出新生成的互补测序链序列(注明5'→3'方向);(2) 在加入ddGTP的反应管中,各终止片段的长度(以核苷酸数表示)分别为多少?(3) 该管中最短终止片段的3'末端是哪种双脱氧核苷酸?
琼脂糖凝胶电泳时,DNA分子在电场中的迁移距离可近似表示为 d = μ×E×t,其中 μ 为该DNA片段在特定凝胶中的迁移率(cm/(V·min)),E 为电场强度(V/cm),t 为电泳时间(min)。某实验中,一双链DNA片段在 5 V/cm 电场强度下电泳 40 min,测得迁移距离为 3 cm。求该DNA片段在此凝胶中的迁移率 μ。
某真核细胞系中,内源基因P的mRNA稳态水平为1400拷贝/细胞。现转入针对P的mRNA的双链siRNA,RNA干扰途径被激活,RISC切割P的mRNA使其一级动力学降解的速率常数由原来的0.1 h⁻¹增大到0.7 h⁻¹,同时基因P的转录速率保持不变。已知mRNA稳态水平与降解速率常数成反比。求:(1) 转入siRNA后P的mRNA新的稳态水平;(2) 若转入后6小时检测,P的mRNA水平约为多少拷贝/细胞(ln2≈0.693,e^(−4.2)≈0.015)?
在大肠杆菌乳糖操纵子中,CAP-cAMP复合物对转录的正调控符合:激活系数 A = [cAMP]/([cAMP]+K_d),其中解离常数 K_d = 1 μmol/L;操纵子转录起始频率 = 最大起始频率 × A × (1 − 阻遏系数)。已知最大起始频率为 30 次/分钟。(1) 培养基仅含葡萄糖时,胞内 [cAMP] = 0.25 μmol/L,阻遏系数为 0;(2) 培养基仅含甘油时,胞内 [cAMP] = 4 μmol/L,阻遏系数为 0;(3) 培养基含葡萄糖和乳糖时,胞内 [cAMP] = 0.25 μmol/L,因诱导物解除阻遏,阻遏系数为 0.8。请分别计算三种条件下的转录起始频率(次/分钟),并根据结果说明 CAP-cAMP 如何作为全局调控因子响应碳源变化。
某原核操纵子从上游到下游依次含四个元件:启动子(P)、操纵基因(O)、结构基因群(如 lacZ 等编码代谢酶的序列)、终止子,此外调节基因位于操纵子之外。已知该操纵子受负调控:当调节基因表达的阻遏蛋白与 O 结合时,RNA 聚合酶虽已结合 P 但无法通过 O 起始结构基因转录。现统计该操纵子各元件中脱氧核苷酸数目:P 为 120 bp,O 为 24 bp,结构基因群共 3054 bp,终止子为 36 bp。若以转录起始后从 O 下游第一个核苷酸开始计(即转录产物不包含 P 与 O 的序列,包含结构基因群全部序列及终止子序列),问一条完整的该操纵子 mRNA 含有多少个核糖核苷酸?终止子在转录产物中对应的序列长度是多少个核苷酸?
某真核生物mRNA的开放阅读框长900个核苷酸(不含终止密码子),核糖体沿mRNA的翻译速率为每秒5个氨基酸。翻译起始后,后续核糖体每隔75个核苷酸(即25个密码子)结合一次该mRNA。若第一个核糖体于t=0秒结合并开始翻译,后续核糖体按此间隔依次结合且速率相同,问第5个核糖体完成整条多肽链合成的时刻是多少秒?
某大肠杆菌菌株乳糖操纵子的最大转录速率为每分钟200个转录本。已知:当葡萄糖充足、cAMP-CAP缺失时,转录速率仅为最大速率的2%;当有乳糖存在使阻遏蛋白脱离操纵基因,且cAMP-CAP结合于启动子上游时,转录达到最大速率的100%。现测得培养条件为:乳糖存在、葡萄糖耗尽(cAMP升高,CAP-cAMP复合物形成并发挥促进转录作用)。设此时阻遏蛋白已完全脱离操纵基因,求该条件下操纵子的转录速率(个转录本/分钟)。
某大肠杆菌细胞中,一种核糖体蛋白的编码基因转录出的mRNA长度为900个核苷酸(含完整编码区)。已知翻译时核糖体沿mRNA每延伸掺入1个氨基酸平均需要0.05秒,翻译起始与终止时间忽略不计。请计算:(1) 该mRNA编码的多肽最多含多少个氨基酸;(2) 一个核糖体完成该多肽翻译所需的时间。
某体外蛋白质合成体系中,目的多肽链由128个氨基酸残基组成,体系中每种氨基酸的tRNA均只能被使用一次,用后必须重新氨酰化。已知氨酰-tRNA合成酶催化tRNA氨酰化时,氨基酸先与ATP反应生成氨酰-AMP并释放焦磷酸,随后氨基酸被转移到tRNA 3'端A76的3′-OH上形成酯键。若不考虑体系中其他耗能过程,仅计算为完成该多肽链的合成所需的tRNA氨酰化步骤,问:共消耗多少个ATP分子?相当于消耗多少个高能磷酸键?
大肠杆菌核苷酸切除修复中,UvrA₂UvrB复合物识别DNA上的一处嘧啶二体后,UvrC在损伤位点5'侧第8个磷酸二酯键处和3'侧第4个磷酸二酯键处各切开一次,随后UvrD解链并释放出含损伤位点的寡核苷酸片段(片段长度=5'侧核苷酸数+3'侧核苷酸数,损伤位点核苷酸计入3'侧)。已知该嘧啶二体由2个相邻嘧啶核苷酸组成。计算被切除片段中不含损伤的完好核苷酸数目。
大肠杆菌错配修复中,MutH在半甲基化GATC位点切开未甲基化的新合成链,随后核酸外切酶从切口向错配方向降解至越过错配位点,再由聚合酶以亲代链为模板重新合成该段。现有一段新复制的DNA,某错配碱基对位于两个GATC位点之间:距左侧GATC位点1200 bp,距右侧GATC位点3800 bp。MutH选择在距离错配较近的GATC位点切口。请计算该次错配修复中被切除降解并重新合成的新链片段长度(以核苷酸数表示)。